MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 16894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016587	CTT	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006211
2	NC_016587	CCG	2	6	106	111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006211
3	NC_016587	CCA	2	6	124	129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006211
4	NC_016587	GCG	2	6	163	168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006211
5	NC_016587	GC	3	6	202	207	0 %	0 %	50 %	50 %	375006211
6	NC_016587	GGCGC	2	10	212	221	0 %	0 %	60 %	40 %	375006211
7	NC_016587	CG	3	6	222	227	0 %	0 %	50 %	50 %	375006211
8	NC_016587	TCG	3	9	234	242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006211
9	NC_016587	ACC	2	6	261	266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006211
10	NC_016587	TAA	2	6	276	281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375006211
11	NC_016587	CCG	2	6	282	287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006211
12	NC_016587	GGC	2	6	301	306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006211
13	NC_016587	GC	3	6	315	320	0 %	0 %	50 %	50 %	375006211
14	NC_016587	GGC	2	6	443	448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006211
15	NC_016587	CCA	2	6	574	579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006212
16	NC_016587	TCG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006212
17	NC_016587	CGTC	2	8	628	635	0 %	25 %	25 %	50 %	375006212
18	NC_016587	CTC	2	6	638	643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006212
19	NC_016587	GCG	2	6	682	687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006212
20	NC_016587	GAT	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006212
21	NC_016587	CGG	2	6	838	843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006212
22	NC_016587	CCA	2	6	874	879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006212
23	NC_016587	GCCG	2	8	986	993	0 %	0 %	50 %	50 %	375006212
24	NC_016587	TCT	2	6	1018	1023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006212
25	NC_016587	GCG	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006212
26	NC_016587	GC	3	6	1050	1055	0 %	0 %	50 %	50 %	375006212
27	NC_016587	GCA	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006212
28	NC_016587	CCGG	2	8	1117	1124	0 %	0 %	50 %	50 %	375006212
29	NC_016587	CGG	2	6	1162	1167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006212
30	NC_016587	CGG	2	6	1187	1192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006212
31	NC_016587	TGG	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006212
32	NC_016587	GCA	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006212
33	NC_016587	GCCGC	2	10	1213	1222	0 %	0 %	40 %	60 %	375006212
34	NC_016587	CGGC	2	8	1264	1271	0 %	0 %	50 %	50 %	375006212
35	NC_016587	GC	4	8	1336	1343	0 %	0 %	50 %	50 %	375006212
36	NC_016587	GCTC	2	8	1354	1361	0 %	25 %	25 %	50 %	375006212
37	NC_016587	CCT	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006212
38	NC_016587	GCAG	2	8	1390	1397	25 %	0 %	50 %	25 %	375006212
39	NC_016587	TCG	2	6	1464	1469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006212
40	NC_016587	TCG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006212
41	NC_016587	GAC	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006213
42	NC_016587	GTC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006213
43	NC_016587	GCTG	2	8	1733	1740	0 %	25 %	50 %	25 %	375006213
44	NC_016587	TGG	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006213
45	NC_016587	GAA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006213
46	NC_016587	GCC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006213
47	NC_016587	GCC	2	6	1899	1904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006213
48	NC_016587	GC	3	6	1915	1920	0 %	0 %	50 %	50 %	375006213
49	NC_016587	GCCG	2	8	1931	1938	0 %	0 %	50 %	50 %	375006213
50	NC_016587	GAC	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006213
51	NC_016587	GCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006213
52	NC_016587	CCG	2	6	2047	2052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006213
53	NC_016587	CAGG	2	8	2073	2080	25 %	0 %	50 %	25 %	375006213
54	NC_016587	GTG	3	9	2101	2109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006213
55	NC_016587	GAC	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006213
56	NC_016587	GTC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006213
57	NC_016587	GAC	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006213
58	NC_016587	GCC	2	6	2142	2147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006213
59	NC_016587	GAC	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006213
60	NC_016587	GCC	2	6	2177	2182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006213
61	NC_016587	GGC	2	6	2199	2204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006213
62	NC_016587	GCG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006213
63	NC_016587	GC	3	6	2241	2246	0 %	0 %	50 %	50 %	375006213
64	NC_016587	CTGT	2	8	2263	2270	0 %	50 %	25 %	25 %	375006213
65	NC_016587	CAT	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006213
66	NC_016587	GTCA	2	8	2422	2429	25 %	25 %	25 %	25 %	375006214
67	NC_016587	GGATG	2	10	2502	2511	20 %	20 %	60 %	0 %	375006214
68	NC_016587	CGC	2	6	2544	2549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
69	NC_016587	GCC	2	6	2588	2593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
70	NC_016587	GCC	2	6	2602	2607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
71	NC_016587	CAG	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
72	NC_016587	G	6	6	2667	2672	0 %	0 %	100 %	0 %	375006214
73	NC_016587	CTC	3	9	2685	2693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006214
74	NC_016587	GCA	2	6	2699	2704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
75	NC_016587	CCG	2	6	2722	2727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
76	NC_016587	GCA	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
77	NC_016587	GCC	2	6	2740	2745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
78	NC_016587	GC	3	6	2761	2766	0 %	0 %	50 %	50 %	375006214
79	NC_016587	GCA	2	6	2852	2857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
80	NC_016587	GCC	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
81	NC_016587	GCG	2	6	2905	2910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006214
82	NC_016587	GTT	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375006214
83	NC_016587	CGGC	2	8	3014	3021	0 %	0 %	50 %	50 %	375006214
84	NC_016587	GCG	2	6	3038	3043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006214
85	NC_016587	CGG	2	6	3062	3067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006214
86	NC_016587	CGG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006214
87	NC_016587	GGC	3	9	3087	3095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006214
88	NC_016587	CCGG	2	8	3101	3108	0 %	0 %	50 %	50 %	375006214
89	NC_016587	GCC	2	6	3124	3129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
90	NC_016587	GCA	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
91	NC_016587	GCC	2	6	3207	3212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
92	NC_016587	CGC	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
93	NC_016587	GCC	2	6	3251	3256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
94	NC_016587	GCCC	2	8	3284	3291	0 %	0 %	25 %	75 %	375006214
95	NC_016587	CAG	2	6	3303	3308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
96	NC_016587	CG	3	6	3309	3314	0 %	0 %	50 %	50 %	375006214
97	NC_016587	GCA	2	6	3398	3403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
98	NC_016587	CGG	2	6	3446	3451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006214
99	NC_016587	AGC	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
100	NC_016587	GCA	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
101	NC_016587	CGC	3	9	3503	3511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
102	NC_016587	CGC	2	6	3527	3532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
103	NC_016587	GCA	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
104	NC_016587	GCC	2	6	3573	3578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
105	NC_016587	GGT	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006214
106	NC_016587	CAG	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006214
107	NC_016587	GCC	2	6	3640	3645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
108	NC_016587	GCC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006214
109	NC_016587	CCCCT	2	10	3765	3774	0 %	20 %	0 %	80 %	375006214
110	NC_016587	ACGG	2	8	3848	3855	25 %	0 %	50 %	25 %	375006214
111	NC_016587	GGC	2	6	3878	3883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006214
112	NC_016587	CGGGT	2	10	3908	3917	0 %	20 %	60 %	20 %	375006214
113	NC_016587	GCG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006215
114	NC_016587	GC	3	6	4057	4062	0 %	0 %	50 %	50 %	375006215
115	NC_016587	GGT	3	9	4068	4076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006215
116	NC_016587	GGC	2	6	4084	4089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006215
117	NC_016587	CTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006215
118	NC_016587	GGT	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006215
119	NC_016587	GTG	2	6	4183	4188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375006215
120	NC_016587	CACCGG	2	12	4194	4205	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375006215
121	NC_016587	TCC	3	9	4231	4239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006215
122	NC_016587	ACC	2	6	4255	4260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375006215
123	NC_016587	GAG	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375006215
124	NC_016587	GCA	2	6	4299	4304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006215
125	NC_016587	TCT	2	6	4307	4312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375006215
126	NC_016587	CTG	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006215
127	NC_016587	GCT	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006215
128	NC_016587	GAC	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006215
129	NC_016587	CGG	2	6	4379	4384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006215
130	NC_016587	AGC	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006215
131	NC_016587	CTA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375006215
132	NC_016587	GCT	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006215
133	NC_016587	CGC	2	6	4461	4466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006215
134	NC_016587	CGCC	2	8	4518	4525	0 %	0 %	25 %	75 %	375006215
135	NC_016587	GCG	2	6	4595	4600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006215
136	NC_016587	GCT	3	9	4611	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006215
137	NC_016587	CGC	2	6	4620	4625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006215
138	NC_016587	GGA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375006215
139	NC_016587	GCT	2	6	4680	4685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006215
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141	NC_016587	G	6	6	4703	4708	0 %	0 %	100 %	0 %	375006215
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144	NC_016587	CGA	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006215
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148	NC_016587	CG	3	6	4813	4818	0 %	0 %	50 %	50 %	375006215
149	NC_016587	GCT	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006215
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248	NC_016587	CGGCG	2	10	7968	7977	0 %	0 %	60 %	40 %	375006218
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250	NC_016587	CG	3	6	7997	8002	0 %	0 %	50 %	50 %	375006218
251	NC_016587	TTGC	2	8	8003	8010	0 %	50 %	25 %	25 %	375006218
252	NC_016587	GGGCTT	2	12	8020	8031	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375006218
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254	NC_016587	GCG	2	6	8063	8068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006218
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259	NC_016587	GCCGG	2	10	8203	8212	0 %	0 %	60 %	40 %	375006218
260	NC_016587	CG	3	6	8236	8241	0 %	0 %	50 %	50 %	375006218
261	NC_016587	GCC	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006218
262	NC_016587	CGC	2	6	8282	8287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006218
263	NC_016587	CGG	2	6	8504	8509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006219
264	NC_016587	AGCTC	2	10	8516	8525	20 %	20 %	20 %	40 %	375006219
265	NC_016587	GGC	2	6	8538	8543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006219
266	NC_016587	GAT	2	6	8553	8558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375006219
267	NC_016587	CGT	2	6	8615	8620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006219
268	NC_016587	CGGCA	2	10	8655	8664	20 %	0 %	40 %	40 %	375006219
269	NC_016587	CGA	2	6	8678	8683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006219
270	NC_016587	GCC	2	6	8685	8690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006219
271	NC_016587	CGA	2	6	8699	8704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006219
272	NC_016587	CAG	2	6	8742	8747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006219
273	NC_016587	GGCCAG	2	12	8748	8759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375006219
274	NC_016587	GCG	2	6	8777	8782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006219
275	NC_016587	CCGA	2	8	8788	8795	25 %	0 %	25 %	50 %	375006219
276	NC_016587	CGG	2	6	8822	8827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006219
277	NC_016587	GGC	2	6	8861	8866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006219
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280	NC_016587	CCT	2	6	8939	8944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006219
281	NC_016587	GCC	2	6	8950	8955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006219
282	NC_016587	CCGA	2	8	8977	8984	25 %	0 %	25 %	50 %	375006219
283	NC_016587	CGA	2	6	9006	9011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006219
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287	NC_016587	CTC	2	6	9099	9104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375006219
288	NC_016587	GC	3	6	9111	9116	0 %	0 %	50 %	50 %	375006219
289	NC_016587	CGA	2	6	9158	9163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006219
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295	NC_016587	AAG	2	6	9322	9327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375006219
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297	NC_016587	GCA	3	9	9374	9382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006219
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300	NC_016587	CCG	2	6	9617	9622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006220
301	NC_016587	CGC	2	6	9627	9632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006220
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305	NC_016587	CCCGT	2	10	9826	9835	0 %	20 %	20 %	60 %	375006221
306	NC_016587	TCG	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006221
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325	NC_016587	TCCCGA	2	12	10649	10660	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	375006221
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384	NC_016587	CTGG	2	8	12665	12672	0 %	25 %	50 %	25 %	375006223
385	NC_016587	GCG	2	6	12721	12726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006223
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390	NC_016587	GTC	2	6	12848	12853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006223
391	NC_016587	GCG	2	6	12901	12906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375006223
392	NC_016587	GCT	2	6	12983	12988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006223
393	NC_016587	GC	4	8	12989	12996	0 %	0 %	50 %	50 %	375006223
394	NC_016587	CCG	2	6	13018	13023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006223
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400	NC_016587	CTG	2	6	13233	13238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375006223
401	NC_016587	CCG	2	6	13240	13245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375006223
402	NC_016587	CGA	2	6	13255	13260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375006223
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500	NC_016587	CGCC	2	8	16880	16887	0 %	0 %	25 %	75 %	375006226

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